Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctr9Q62018 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctr9Q62018 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms