Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Lrrn1Q61809 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn1Q61809 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Lrrn1Q61809 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Lrrn1Q61809 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Lrrn1Q61809 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Lrrn1Q61809 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn1Q61809 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Lrrn1Q61809 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn1Q61809 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn1Q61809 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn1Q61809 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrn1Q61809 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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