Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irf9Q61179 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf9Q61179 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms