Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf3Q60803 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf3Q60803 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms