Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atf3Q60765 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf3Q60765 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms