Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmelQ60696 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmelQ60696 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmelQ60696 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmelQ60696 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmelQ60696 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmelQ60696 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmelQ60696 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PmelQ60696 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PmelQ60696 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmelQ60696 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms