Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Foxd4Q60688 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms