Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myh1Q5SX40 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms