Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med13Q5SWW4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms