Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ssh2Q5SW75 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ssh2Q5SW75 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ssh2Q5SW75 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ssh2Q5SW75 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ssh2Q5SW75 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ssh2Q5SW75 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ssh2Q5SW75 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ssh2Q5SW75 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ssh2Q5SW75 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ssh2Q5SW75 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ssh2Q5SW75 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ssh2Q5SW75 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ssh2Q5SW75 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ssh2Q5SW75 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ssh2Q5SW75 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ssh2Q5SW75 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ssh2Q5SW75 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ssh2Q5SW75 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ssh2Q5SW75 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ssh2Q5SW75 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ssh2Q5SW75 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ssh2Q5SW75 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ssh2Q5SW75 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ssh2Q5SW75 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ssh2Q5SW75 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ssh2Q5SW75 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ssh2Q5SW75 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ssh2Q5SW75 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ssh2Q5SW75 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ssh2Q5SW75 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ssh2Q5SW75 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ssh2Q5SW75 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms