Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam71bQ5STT6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam71bQ5STT6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms