Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme4Q5SSW2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms