Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rapgef6Q5NCJ1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms