Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm12253Q5NC48 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm12253Q5NC48 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm12253Q5NC48 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm12253Q5NC48 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm12253Q5NC48 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm12253Q5NC48 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm12253Q5NC48 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm12253Q5NC48 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm12253Q5NC48 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm12253Q5NC48 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm12253Q5NC48 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm12253Q5NC48 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm12253Q5NC48 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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