Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5EBG8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5EBG8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5EBG8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5EBG8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5EBG8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5EBG8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5EBG8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5EBG8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5EBG8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5EBG8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q5EBG8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q5EBG8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms