Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Nlrc3Q5DU56 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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Nlrc3Q5DU56 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Nlrc3Q5DU56 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Nlrc3Q5DU56 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Nlrc3Q5DU56 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nlrc3Q5DU56 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms