Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp22Q5DU02 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms