Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Znf354cQ571J5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms