Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opa3Q505D7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opa3Q505D7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms