Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc84Q4VA36 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms