Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brinp3Q499E0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brinp3Q499E0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms