Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1nQ497L1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1nQ497L1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1nQ497L1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1nQ497L1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1nQ497L1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1nQ497L1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1nQ497L1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1nQ497L1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1nQ497L1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1nQ497L1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1nQ497L1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1nQ497L1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1nQ497L1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1nQ497L1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1nQ497L1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1nQ497L1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1nQ497L1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1nQ497L1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1nQ497L1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1nQ497L1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1nQ497L1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1nQ497L1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1nQ497L1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2al1nQ497L1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms