Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc160Q3UYG1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms