Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Arhgef40Q3UPH7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Arhgef40Q3UPH7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Arhgef40Q3UPH7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Arhgef40Q3UPH7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Arhgef40Q3UPH7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Arhgef40Q3UPH7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Arhgef40Q3UPH7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Arhgef40Q3UPH7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Arhgef40Q3UPH7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Arhgef40Q3UPH7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Arhgef40Q3UPH7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Arhgef40Q3UPH7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Arhgef40Q3UPH7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Arhgef40Q3UPH7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Arhgef40Q3UPH7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Arhgef40Q3UPH7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
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