Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nhlrc4Q3UP44 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms