Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrch2Q3UMG5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrch2Q3UMG5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrch2Q3UMG5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrch2Q3UMG5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrch2Q3UMG5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms