Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mccc2Q3ULD5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mccc2Q3ULD5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mccc2Q3ULD5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mccc2Q3ULD5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mccc2Q3ULD5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms