Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dtx3lQ3UIR3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dtx3lQ3UIR3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dtx3lQ3UIR3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dtx3lQ3UIR3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dtx3lQ3UIR3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dtx3lQ3UIR3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dtx3lQ3UIR3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dtx3lQ3UIR3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dtx3lQ3UIR3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dtx3lQ3UIR3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dtx3lQ3UIR3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dtx3lQ3UIR3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dtx3lQ3UIR3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Dtx3lQ3UIR3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dtx3lQ3UIR3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dtx3lQ3UIR3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dtx3lQ3UIR3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dtx3lQ3UIR3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dtx3lQ3UIR3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dtx3lQ3UIR3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dtx3lQ3UIR3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dtx3lQ3UIR3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dtx3lQ3UIR3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms