Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnrc6cQ3UHC0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnrc6cQ3UHC0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms