Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgef3Q3UGY8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef3Q3UGY8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef3Q3UGY8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef3Q3UGY8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef3Q3UGY8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef3Q3UGY8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef3Q3UGY8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgef3Q3UGY8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef3Q3UGY8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef3Q3UGY8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef3Q3UGY8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef3Q3UGY8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef3Q3UGY8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef3Q3UGY8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef3Q3UGY8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef3Q3UGY8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms