Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Puf60Q3UEB3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Puf60Q3UEB3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms