Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3R4

Lmf1, Lipase maturation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmf1Q3U3R4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmf1Q3U3R4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms