Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem88bQ3TYP4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem88bQ3TYP4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms