Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc17a7Q3TXX4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc17a7Q3TXX4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms