Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9M1

Mfsd2b, Major facilitator superfamily domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd2bQ3T9M1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mfsd2bQ3T9M1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd2bQ3T9M1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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