Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rpusd3Q14AI6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rpusd3Q14AI6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rpusd3Q14AI6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rpusd3Q14AI6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Rpusd3Q14AI6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Rpusd3Q14AI6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd3Q14AI6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Rpusd3Q14AI6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Rpusd3Q14AI6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rpusd3Q14AI6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rpusd3Q14AI6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd3Q14AI6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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