Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gli2Q0VGT2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms