Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b3Q0VF55 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b3Q0VF55 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms