Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem52bQ0VBF2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem52bQ0VBF2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem52bQ0VBF2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms