Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NeblQ0II04 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NeblQ0II04 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms