Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700061G19RikQ08EE8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms