Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cass4Q08EC4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cass4Q08EC4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms