Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GscQ02591 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GscQ02591 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GscQ02591 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GscQ02591 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GscQ02591 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GscQ02591 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GscQ02591 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GscQ02591 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GscQ02591 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GscQ02591 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GscQ02591 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GscQ02591 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GscQ02591 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GscQ02591 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GscQ02591 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GscQ02591 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GscQ02591 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GscQ02591 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GscQ02591 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GscQ02591 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GscQ02591 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GscQ02591 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GscQ02591 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GscQ02591 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GscQ02591 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GscQ02591 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GscQ02591 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GscQ02591 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GscQ02591 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GscQ02591 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GscQ02591 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GscQ02591 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GscQ02591 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GscQ02591 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GscQ02591 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GscQ02591 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GscQ02591 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GscQ02591 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GscQ02591 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GscQ02591 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GscQ02591 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GscQ02591 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GscQ02591 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GscQ02591 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GscQ02591 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GscQ02591 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GscQ02591 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GscQ02591 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GscQ02591 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
GscQ02591 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GscQ02591 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GscQ02591 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GscQ02591 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GscQ02591 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GscQ02591 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GscQ02591 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GscQ02591 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GscQ02591 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GscQ02591 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GscQ02591 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GscQ02591 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GscQ02591 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GscQ02591 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GscQ02591 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GscQ02591 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GscQ02591 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GscQ02591 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GscQ02591 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GscQ02591 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GscQ02591 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GscQ02591 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GscQ02591 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GscQ02591 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GscQ02591 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GscQ02591 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GscQ02591 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GscQ02591 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GscQ02591 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GscQ02591 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GscQ02591 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GscQ02591 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GscQ02591 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GscQ02591 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GscQ02591 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GscQ02591 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GscQ02591 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GscQ02591 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GscQ02591 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GscQ02591 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GscQ02591 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GscQ02591 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GscQ02591 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GscQ02591 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GscQ02591 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GscQ02591 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GscQ02591 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GscQ02591 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GscQ02591 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GscQ02591 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms