Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlh1Q02576 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nhlh1Q02576 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms