Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnnb1Q02248 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnnb1Q02248 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnnb1Q02248 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnnb1Q02248 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnnb1Q02248 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnnb1Q02248 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnb1Q02248 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnb1Q02248 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnb1Q02248 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnb1Q02248 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnb1Q02248 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnb1Q02248 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnb1Q02248 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnb1Q02248 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnb1Q02248 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnb1Q02248 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnb1Q02248 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnb1Q02248 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnnb1Q02248 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctnnb1Q02248 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms