Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gbp1Q01514 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbp1Q01514 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms