Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Top2aQ01320 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Top2aQ01320 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Top2aQ01320 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Top2aQ01320 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms