Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin2cQ01098 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin2cQ01098 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms