Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Grin2bQ01097 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Grin2bQ01097 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.4 ms