Protein–RNA interactions for Protein: Q00898

Serpina1e, Alpha-1-antitrypsin 1-5, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1eQ00898 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Serpina1eQ00898 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serpina1eQ00898 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms